留下来的破坏痕迹，拖了好一段时间才有人回来修复。
过去这些修复工作的资金，都是SEELE旗下的组织在出，但是现如今，日本和SEELE摊牌了，加持良治暂时离开了第三新东京市，他和政府一起，在国际社会上宣传与第二次冲击的真相，争取拉拢盟友和资金。
“虽然你想让我来当新司令，但是你也看到了，我现在脱不开身。”加持良治在电话里和伊恩通话：“我们和SEELE已经进入冷战了，他们没有对我们的举动有特别大的表示，也没有站出来发声，但我们不可能再从他们那里获得任何的资金和支援了。”
“相比EVA，日本政府更愿意信任你，如果使徒再次来袭的话，他们希望你能出击，也就是让你成为NERV本部的新司令，你可以调动周边的军队和资源，来歼灭使徒，我是来征求你的想法的，你愿不愿接受这个职位？”
“这样么”伊恩琢磨了一下。
原本他对司令没什么想法，但现在好像的确也没有合适的人选了。
反正使徒始终是要全部消灭的，这一点避不开。
“我明白了，一下子就给我升这么大的官，那必须得办一个庆祝会了呢。”伊恩说。
“总而言之，使徒就拜托你了，SEELE下一步准备做什么，我会努力调查的。”加持良治说。
“别死了啊，加持先生。”伊恩说。
“我死了，美里会流泪的，所以我尽量不会死的。”加持开玩笑道：“就聊到这里吧，我还有其它的事情要做，负责程序交接的人已经在路上了，他们会联系你的。”
说完加持良治挂断了电话，当天傍晚，政府方的人，来核对了他的身份，把手续办好。
伊恩成为了NERV的新司令，他上任后的第一件事情，是把原在NERV工作的员工放了出来。
除了MAGI相关的员工，其他人都让他们各自回到自己的岗位去。
这些人很多是不知情人，就算真的有SEELE的眼线，也无所谓，SEELE爱探情报，就让他们探呗。
伊恩无所谓他们探不探情报，况且，对SEELE来说，消灭使徒也是必须完成的事情，如果使徒出现，SEELE绝不会让自己的人捣乱，依然会把消灭使徒当做第一事宜。
伊恩大胆地用这些人，让他们重新工作。
之后，他调用权限，把S2机关转移到了过来，最关键的地方，他交给了自己人，让汉吉队长协助他。
碇真嗣也随同S2机关一起，回到了第三东京市。
这个时候，已经是第九使徒被歼灭的第二周了。
“真嗣君，情况你都了解了吧。”伊恩与碇真嗣，回到了之前他们住过的公寓。
“但是.我真的可以走吗？”真嗣有些胆怯。
“放心吧。”伊恩揉了揉真嗣的头：“无论驾驶EVA还是不驾驶EVA，那都是你自己做出的决定，遵从你自己内心的想法就好了，现在不会有人强迫你的。”
“去收拾行李吧，今晚我们给你办一个送别会，绫波，明日香和美里小姐都会来的，今天以后，你就像以前那样，去你的老师那里生活吧，不用担心生活费，我会替你出的。”
碇真嗣站在空荡荡的门前，虽然一直说着要不想再驾驶EVA，但是真的到了这个时候，他却觉得心里空落落的。
就这么走了，意味着他要和第三东京市的一切告别，那些回忆也是。
他站了一会儿，听到了伊恩的电话铃响。
“是使徒，在印度洋上空发现了使徒，两分钟前突然出现在了卫星轨道上！”电话那头传来美里的声音。
“我知道了，我马上过来。”伊恩点头：“抱歉，真嗣，送别会要延期了，你先去地下都市避难吧，处理完第十使徒，我会来找你的。”
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